En 1484, alors que la guerre civile fait rage au Japon, le Bioking, un robot géant venu tout droit de la planète Bio, réunit 5 jeunes gens qu'il annonde de bio-particules dans l'espoir que les futures générations puissent intervenir en cas de danger. 500 ans plus tard, le Bioking se réveille. La Terre étant en péril, il recherche les descendants des 5 japonais irradiés afin de leur faire prendre conscience de leur pouvoir et de leur destinée : combattre le Docteur Mad et son empire pour sauver la Terre.