Le soldat Joe Armstrong et le sergent Curtis Jackson débarquent sur l'île de Saint Thomas, dans les Caraïbes. Ils ont pour mission Top Secrète d'enquêter sur plusieurs disparitions mystérieuses de soldats américains. Très rapidement, Joe Armstrong et Curtis Jackson découvrent l'existence d'une base secrète où les militaires disparus sont reconditionnés pour devenir de redoutables guerriers Ninjas ....